关键词： 转录调控蛋白   生物传感器   计算模拟   蛋白质工程   机器学习  

摘要： 基于转录调控蛋白的生物传感器已在代谢工程、合成生物学、代谢物监测等领域发挥重要作用。该工具具有高度模块化、正交性、易于构建及操作等优良特性，但在实际应用中，天然调控蛋白对目标化合物的响应仍然存在响应程度较低、特异性不符合需求等缺陷。本文综述了近年来在计算机模拟和人工智能技术辅助下，采用蛋白质工程手段，智能设计、改造转录调控蛋白以提升其工作性能所取得的研究进展。主要包括利用蛋白质结构预测、配体结合模拟等优化改造策略快速获取目标突变体，或借助对突变体数据分析并经机器学习等构建数学模型，预测转录调控蛋白突变响应效果等。相较于传统方式，计算机模拟和人工智能辅助技术可实现对生物元件更精准快捷地设计构建，将推动新型生物传感器的创制研发，更好地满足实际应用的需求。

关键词： 新德里番茄曲叶病毒   重组聚合酶扩增技术   快速检测   监测预警  

摘要： [目的]新德里番茄曲叶病毒（tomatoleafcurlNewDelhivirus，ToLCNDV）严重威胁我国茄科和葫芦科作物的生产，本研究旨在建立针对该病毒的快速检测方法，为病害的监测和防控奠定基础。[方法]针对ToLCNDV基因组A的保守区域设计了两对特异性引物，经过筛选后选用其中一对引物建立了针对ToLCNDV的重组聚合酶扩增（recombinase polymerase amplification， RPA）检测方法。[结果]该方法可在42℃恒温条件下，仅用30 min完成对ToLCNDV的指数级扩增，扩增产物既可通过琼脂糖凝胶电泳进行观察，又能通过测流层析试纸条实现检测结果的快速可视化。经特异性检测发现，本研究所建立的RPA技术可特异性地检出ToLCNDV，而检测不到番茄黄化曲叶病毒（tomato yellow leaf curl virus， TYLCV）、番茄金色花叶病毒（tomato golden mosaic virus， TGMV）、云南番茄曲叶病毒（tomato leaf curl Yunnan virus， TLCYnV）和中国南瓜曲叶病毒（squash leaf curl China virus， SLCCNV）等侵染茄科和葫芦科作物的其它DNA病毒。另外，在测试灵敏度时发现，当模板DNA浓度稀释到5×10-7ng时RPA仍能检测为阳性结果，而常规聚合酶链式反应（polymerase chain reaction， PCR）检测的最低模板含量仅为0.05 ng，说明RPA检测ToLCNDV的灵敏度显著高于常规PCR。[结论]本研究所研发的ToLCNDV快速检测方法为建立该病毒的早期监测预警和综合防控技术体系奠定了基础。

摘要： 页面尚无资料

关键词： 手足口   柯萨奇病毒A6型   VP1基因   基因特征  

摘要： 目的 分析2018—2022年成都市手足口病柯萨奇病毒A6型（coxsackievirus A6,CVA6）基因特征，为手足口病的预防控制提供依据。方法 收集2018—2022年手足口病人中为CV A6阳性的样本168份，采用RT-PCR法扩增CVA6VP1基因并测序，使用MEGA 7.0软件进行序列分析、进化树构建及比较核苷酸、氨基酸同源变异情况。结果 基因进化分析显示，168株CV A6位于同一分支，均属于D基因型中的D3a基因亚型，与Gdula原型株处于不同分支，亲缘关系较远。168株样本的氨基酸序列VP1区与原型株Gdula株比较共有26个位点的氨基酸发生了变异。结论 2018—2022年成都市引起手足口病的CV A6属于D3a亚型，VP1区基因存在多个氨基酸变异位点。应加强对CV A6的持续监测及基因特征分析，为有效防控手足口病提供科学依据。

关键词： 猪伪狂犬病毒   中和抗体   gD-ELISA  

摘要： 为开发一种能测定中和抗体水平并有效评估猪伪狂犬疫苗免疫效果的ELISA试剂盒，本研究创新性采用HEK293T细胞表达的猪伪狂犬病毒（PRV）gD重组蛋白作为包被抗原建立gD-ELISA检测方法。该方法与衣原体（CP）、口蹄疫病毒（FMDV）、猪流行性腹泻病毒（PEDV）、猪圆环病毒（PCV）、猪乙型脑炎病毒（JEV）、猪细小病毒（PPV）、猪瘟病毒（CSFV）、猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）无交叉反应，特异性好；PR阳性血清稀释64 000倍仍可检出，灵敏性高；批间和批内重复变异系数均小于10.58%，重复性好；与商品化抗体检测试剂盒平行检测180份猪血清样品，总符合率为83.33%；与中和试验结果比较，gD-ELISA符合率均为100%，相关系数r为0.903，相关性更高。本研究建立的gD-ELISA更适合作为中和试验的替代方法，为PRV中和抗体效价检测和疫苗免疫效果评估提供了新工具。

关键词： l-色氨酸   生物传感器   高通量筛选   动态调控   实验室进化  

摘要： 生物传感器由生物识别元件和信号转换元件组成，能将目标化合物的浓度信号转化为易于检测的信号，现已被广泛应用于医药、环境、食品等各个领域。目前，可调节的色氨酸生物传感器在色氨酸及其衍生物的代谢工程和合成生物学研究中发挥着重要的作用，不同色氨酸生物传感器由于工作原理不同，在实际应用中具有各自的优势。本文综述了色氨酸生物传感器的研究进展，主要包括色氨酸生物传感器的类别、作用原理及优化策略，重点介绍了其在合成生物学中的典型应用实例。最后，针对色氨酸生物传感器设计与构建过程中面临的问题，提出了相应的解决方案，并对其发展趋势进行了展望。