关键词:
获得性免疫缺陷综合征
HIV
宏基因组学二代测序
病原学检测
肺部感染
疾病谱
摘要:
目的了解本地区艾滋病患者合并肺部机会性感染的病原谱, 并评价宏基因组学二代测序(mNGS)在艾滋病合并肺部感染患者中的临床应用。方法以2021年1月至12月在武汉大学中南医院住院的艾滋病合并肺部感染患者为研究对象, 对其支气管肺泡灌洗液(BALF)进行mNGS和常规病原学检测。常规病原学检测方法包括涂片、培养、聚合酶链反应(PCR)和免疫层析胶体金法。统计学方法采用Fisher确切概率法。结果共纳入69例患者, 其mNGS检测结果均为阳性, 其中真菌和病毒各检测出53例次(76.8%), 细菌[不包括结核分枝杆菌(MTB)和非结核分枝杆菌(NTM)]40例次(58.0%), MTB 6例次, NTM 11例次, 其他7例次;89.9%(62/69)的患者为2种或以上病原体的混合感染。BALF的常规病原学检测中, 79.7%(55/69)的患者检出病原体阳性, 包括耶氏肺孢子菌聚合酶链反应(PCR)检测阳性42例次, BALF培养阳性16例次, MTB PCR检测阳性9例次, 隐球菌抗原阳性5例次。mNGS总检出率为100.0%(69/69), 高于常规病原学检测的79.7%(55/69), 差异有统计学意义(Fisher确切概率法, P<0.001)。mNGS检测特异度为88.4%。结合临床及2种检测方法, 前5位的病原体分别为耶氏肺孢子菌[62.3%(43/69)]、念珠菌[29.0%(20/69)]、MTB[20.3%(14/69)]、NTM和马尔尼菲篮状菌[各15.9%(11/69)]。76.8%(53/69)的患者合并病毒感染。结论本地区艾滋病患者合并肺部感染的病因以混合感染为主, 耶氏肺孢子菌为最常见的病原体。mNGS可提高艾滋病合并肺部感染患者的病原体检出率。