关键词:
基因组学
结核分枝杆菌
诊断技术和方法
摘要:
目的评价宏基因组学二代测序(mNGS)对结核性脑膜炎(TBM)的诊断价值。方法纳入2020年8月1日至2022年8月31日浙江大学医学院附属杭州市胸科医院结核病诊疗中心收治的99例疑似TBM患者,对其脑脊液进行mNGS、利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测和分枝杆菌培养检测。通过比较3种检验方式的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、一致率、Kappa值评价其诊断价值,并绘制mNGS诊断效能的受试者操作特征曲线(ROC曲线)进行分析。统计学方法采用χ^(2)检验和秩和检验。结果99例疑似TBM患者中,TBM者67例,非TBM者32例。以67例临床诊断为TBM的结果为标准,mNGS诊断TBM的灵敏度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、一致率、Kappa值分别为82.1%、100.0%、100.0%、72.7%、87.9%、0.748,其中灵敏度高于利福平耐药实时荧光定量核酸扩增检测的50.7%和分枝杆菌培养的28.4%,差异均有统计学意义(χ^(2)=12.61、32.42,均P<0.01)。mNGS检测所需时间为1.0(1.0,2.0)d,短于分枝杆菌培养的42.0(42.0,42.0)d,差异有统计学意义(Z=10.80,P<0.001)。ROC曲线分析显示,当mNGS检测脑脊液中结核分枝杆菌序列数为1个时,其诊断效能最佳。结论mNGS在TBM诊断中的灵敏度和特异度均较高,所需时间较短,可早期用于TBM诊断。