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摘要： Oomycete and fungal pathogens threaten food, fiber, and forests around the world. With climate change, these pathogens are expected to emerge more frequently. Evolution can facilitate their emergence through mechanisms such as mutations that change or expand host range. Characterizing evolutionary mechanisms in plant pathogens will contribute to our ability to predict how or when a pathogen might emerge. This dissertation used population and comparative genomic approaches to characterize patterns of emergence in two species of plant pathogenic oomycetes. The focus of this dissertation is on Phytophthora ramorum, the causal agent of sudden oak death and a threat to forests in the Western US and in Europe. Many oomycetes and fungi including P. ramorum have mixed mating systems, allowing them to reproduce sexually and asexually. Divergent lineages of P. ramorum have survived millions of years primarily clonally, and lineages have repeatedly re- emerged, making this a useful study system to understand how the costs of asexuality can be overcome. Describing pathways in which pathogens move into and within ecosystems is important to reduce disease outbreaks. The nursery industry is an important component of the pathway in which pathogens are introduced to ecosystems. In chapter two we analyzed a collection of P. plurivora from Oregon nurseries to characterize genetic diversity. I show that the meta-population among four nurseries is dominated by one single clone, but there is additional cryptic diversity. In chapters three and four, I show that the clonal lineage EU1 was introduced only once in a four- year period after the outbreak was found. I also show that currently, there is more diversity in the population of the clonal lineage NA1 than in the population of the EU1 clonal lineage. This is consistent with population genetic theory, since the NA1 population has accumulated mutations over a longer period of time. This work also compares the two P. ramorum lineages duri

关键词： 弗雷德里克·基斯勒   环境调控   具身感知   关联主义   生物技术  

摘要： 以“身体”这一传统建筑学议题为线索,梳理弗雷德里克·基斯勒的理论与实践,揭示其所塑造的“感知身体”是对现代主义机械范式下“医学身体”的一种修正;进而以“具身感知”“关联主义”与“生物技术”等理论概念及设计作品的阐释,将基斯勒之于环境调控的价值贡献归纳为“身体性”“相关性”和“连续性”;丰富环境调控语境下当代建筑的价值取向、系统结构与技术呈现,回应当前学科与行业、理论与技术所面临的危机与挑战。

关键词： 生物技术   环保工程   应用  

摘要： 在我国经济和社会不断高速发展的背景下,环保工程开展得到了史无前例的重要发展机会。因此,在环保工程中,怎样运用科学、规范化的生物技术,对环保工程的执行成效进行全方位的最优和最大程度的提高,是业界普遍关心的一个热点问题。基于此,本文首先阐明了生物技术应用的重要性,分析了环境保护中生物技术的具体应用,并结合相关的工作实践,从不同的视角和层面,完善了现代生物技术的使用方法,提出了一种有效的方式来优化环保工程中生物技术的使用效果,从而达到了对环境保护的实施效果的控制。

关键词： 生物经济   生物技术   生物资源  

摘要： 生物经济展现出巨大发展潜力,在推动经济社会转型与发展中发挥着越来越重要的作用,在技术创新、供给需求、资源保障、治理体系等领域均呈现出新特征。在技术创新方面,全球生物科技蓬勃发展,前沿技术、交叉融合技术、辅助技术不断突破;在供给方面,生物经济相关企业、产业快速发展,相关技术广泛用于提高经济社会发展的质量和可持续性,供给质量不断提升;在需求方面,市场导向的发展路径更加明确,支持手段更加多元,需求空间持续拓展;在资源保障方面,动植物资源、人类遗传资源等传统生物资源的保护和生物大数据等新资源的开发并举;在治理体系方面,顶层设计、监测和评估、监管和支持、法律法规和公众沟通等举措多管齐下。

关键词： 霍乱弧菌   染色体   融合   生长   attB位点  

摘要： 目的 研究1株罕见的两条染色体融合为单染色体的霍乱弧菌菌株的基因组及其生物学特征,并与典型的具有两个染色体的霍乱弧菌进行比较。方法 通过短读长和长读长测序相结合的方法测定及分析单染色体菌株VC6047的基因组特征,分析融合方式。通过透射电镜观察菌体形态,观察不同培养温度、pH值、盐浓度和M9以及LB培养基下菌株的生长状况,分析生物膜形成能力以及进入活的非可培养状态(viable but non-culturable, VBNC)的生物学特征。结果 菌株VC6047呈现典型的弧菌特征,染色体的融合位置对应于霍乱弧菌大、小染色体的att B位点(染色体附着位点),也是霍乱弧菌丝状溶源性噬菌体CTXΦ整合的位置。该菌株与第七次大流行菌株处于不同进化分支。培养18 h后,25℃LB培养基条件下以及在37℃,4.0%和5.0%盐浓度LB培养基中菌株VC6047生长高于对比菌株。菌株VC6047仍然具有生物膜形成能力,但相比较于其基因组高度同源的,仍为两个染色体的菌株,菌株VC6047进入VBNC的速率加快,冷适应能力有所降低。结论 大小染色体融合菌株仍基本保持应对优劣环境压力的能力,但发生了一些环境压力适应变化,为菌株染色体融合可能的促成压力研究和微环境适应提供了基础认识。

关键词： 海湾扇贝南部亚种   单核苷酸多态性   遗传分化   选择性清除  

摘要： 为了探究海湾扇贝南部亚种(Argopecten irradians concentricus)的遗传多样性特征,通过全基因组重测序分析,系统解析了其群体遗传结构以及其与海湾扇贝北部亚种(Argopecten irradians irradians)间的遗传差异,共筛查出15059961个高质量单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)位点。基于全基因组SNP的群体祖先成分推断、主成分分析和系统发生重构皆表明,南北亚种之间存在较为显著的遗传分化。其中,海湾扇贝南部亚种的近交水平和连锁不平衡程度更高。通过选择性清除分析,在海湾扇贝南部亚种中共鉴定出349个正选择基因,其中GHSR、HSF1、HABP2和Dna J等基因可能与其生长速度较快、耐热性较强以及免疫功能较强等环境适应性特征相关。该研究揭示了海湾扇贝亚种间遗传分化和选择特征,为扇贝的基因组研究和分子育种提供了数据支持。

关键词： 陈国强   工业生物技术   代谢工程   系统生物学   嗜盐菌   开发利用   卓越贡献   下一代  

摘要： 近日,国际权威学术组织、国际代谢工程学会宣布,将2023年度国际代谢工程奖授予中国学者、清华大学生命科学学院教授、合成与系统生物学中心主任陈国强,以表彰他通过开发利用嗜盐菌和“下一代工业生物技术”对全球代谢工程领域所作出的卓越贡献。

关键词： 海洋生物技术   教学模式   教学质量   改革  

摘要： 《海洋生物技术》是涉海院校开设的一门涵盖多学科内容的重要专业基础课程,也是一门理论与应用紧密结合的综合性课程。本文结合近三年来对海洋生物技术课程教学的经验和体会,针对学生在学习过程中存在的问题,从教学内容、教学过程及手段以及考核方式等方面进行了一系列的教学改革活动,包括优化课程内容,增加“海洋”科研领域的应用实例等,并加入了“翻转课堂”等新的教学模式,以便充分发挥学生学习的主观能动性,为全面提高学生的综合素质、培养创新性的人才奠定基础。

关键词： WO_(3)/LiV_(3)O_(8)   锂离子   电控离子交换   吸附容量   选择性分离  

摘要： 首先通过水热合成制备了六方隧道结构的WO_(3),然后再通过两步法将LiV_(3)O_(8)与WO_(3)进行复合,制备成WO_(3)/LiV_(3)O_(8)复合材料。随后采用XRD、SEM、EDS等手段对该复合材料进行了结构表征,并考察了不同复合比例的WO_(3)/LiV_(3)O_(8)电控离子交换(ESIX)性能。实验结果表明,LiV_(3)O_(8)与WO_(3)成功复合,其中WO_(3)(10%)/LiV_(3)O_(8)的电化学性能最佳。将WO_(3)(10%)/LiV_(3)O_(8)涂覆到预处理好的碳纸上,制备成电活性功能膜,采用ESIX技术在30 mg/L的含Li^(+)溶液中对Li^(+)进行电化学吸附,在电位为-1.0 V(***)时吸附容量最大,为14.2 mg·g^(-1)。在三种离子浓度均为0.015 mol/L的Li^(+)、Mg^(2+)、K^(+)混合溶液中测试了该材料的选择性,Li^(+)/Mg^(2+)和Li^(+)/K^(+)的选择性系数分别为15.88和52.23,五次吸附-脱附循环后,Li^(+)的吸附容量仍能保持初始容量的87.8%。WO_(3)/LiV_(3)O_(8)对Li^(+)吸附表现出较高的吸附选择性,且复合材料具有一定的可重复使用性。