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关键词： 稳定同位素探针技术   宏基因组学   微生物   转化/降解机制   环境污染物  

摘要： 稳定同位素探针技术(SIP)结合宏基因组学在环境污染物微生物转化/降解研究中的应用已逐渐成为趋势.该组合技术不依赖纯培养方法,能够从复杂自然环境中鉴定出具有特定代谢功能的微生物类群,揭示污染物的微生物代谢途径,在研究污染物的原位微生物转化/降解过程方面具有显著优势.本文综述了该组合技术在探究不同环境介质中烃类化合物及其衍生物、有机农药、重金属和新型污染物微生物转化/降解过程中的应用进展,包括功能微生物的识别和污染物微生物转化/降解机制的解析等.最后,基于该组合技术的应用现状进行了展望,提出未来该组合技术与多种原位表征技术的联用将为微生物驱动污染物的转化/降解机制研究提供更准确全面的信息.

关键词： 鲤疱疹病毒2型   基因组学   蛋白功能  

摘要： 从流行病学和病原学方面简述了鲤疱疹病毒2型(Cyprinid herpesvirus 2,CyHV-2),对感染CyHV-2的金鱼、鲫的状态进行了比较。通过GenBank数据库查找,显示CyHV-2完整基因序列有7株,虽然这7株的基因组具有很高的同源性,但是不同的分离株在其基因组中包含很多突变、插入、缺失和重排。CyHV-2基因组约含150个ORF,其中部分ORF的功能在病毒感染过程中起重要作用。CyHV-2是一种具有高度传染性的病原体,主要感染金鱼、鲫及其变种,严重危害金鱼和异育银鲫养殖业发展。指出,应以CyHV-2的基因组序列为基础,加强对CyHV-2的基因功能以及宿主对CyHV-2的免疫反应等基础研究,以获得更有效地预防、控制和治疗方法,遏制其病毒的传播扩散。

关键词： 念珠菌阴道炎   阴道微生物组   宏基因组学  

摘要： 目的探讨念珠菌阴道炎(VVC)患者和健康者阴道分泌物中微生物结构、组成、功能及代谢的差异。方法选取2020年12月至2022年12月四川省自贡市第四人民医院收治的VVC患者100例纳入研究组,另选取100例健康女性纳入对照组。收集所有受试者阴道分泌物,通过宏基因组测序分析微生物类型和微生物基因组数据,明确差异性和功能性。结果比较两组女性的基线资料,体质量指数(BMI)、Amsel标准(乳灰色分泌物、平均阴道pH、阳性嗅觉试验和线索细胞阳性)和Nugent评分差异具有统计学意义(P<0.05)。研究组阴道微生物组的多样性显著低于对照组,微生物基因组丰度显著低于对照组(P<0.05)。通过微生物差异性分析发现,选取16种差异性微生物,其中4种菌株在对照组阴道中未发现,而在研究组阴道中明显存在且丰度较高;8种菌株在对照组中存在且丰度较高,但在研究组阴道中没有检测到;其余4种菌株丰度差异较大。阴道微生物的功能及代谢存在明显的差异性。结论女性阴道微生物群中的细菌在健康和体内平衡中起着重要作用,更好地了解正常和健康的阴道生态系统,基于其真实功能,将有助于更好地定义健康,进一步改善疾病诊断,以及制定更个性化的方案以促进健康和治疗疾病。

关键词： 污染土壤修复技术   类型和来源   生物技术   物理修复技术   化学修复技术   发展趋势  

摘要： 本文通过对污染土壤修复技术研究现状与趋势的探讨,对污染土壤的类型和来源进行了分析,并概述了主要污染物种类及其特点,以及污染土壤的主要来源和分布情况。针对土壤污染修复,本文综合了生物技术、物理修复技术和化学修复技术等方面的研究现状。在研发污染土壤修复技术时,需要注意我国土壤污染情况的分析,并注重自主研发。最后,本文指出了土壤污染修复技术的发展趋势,包括建立土壤污染修复标准体系和促进多项修复技术联合发展。本文的研究对于促进污染土壤修复技术的发展和应用具有重要的参考价值。

关键词： 环保工程   生物技术   微生物   可持续  

摘要： 近年来,我国经济快速发展,对环境保护也越来越重视。为了减少工业快速发展对自然生态系统的破坏,我国出台了很多环境保护政策。生物技术已被广泛应用于环保工程中,该技术可以有效处理自然环境中的废气、废水和其他污染物。主要介绍了利用生物技术处理废气、废水和固体废弃物的方法,详细分析了生物膜技术的原理和工艺等,希望能促进该技术的推广,使其在环保工程中发挥更大作用。

关键词： 结构构型   人类遗传学   变异检测   单个个体   人类基因组   基因组学   GRC   高度多态性  

摘要： 人类参考基因组(Human Reference Genome)自20多年前首次草图发布以来,作为现代人类遗传学和基因组学的基础开放资源,对基础、转化和临床研究发挥了至关重要的作用[1]。人类参考基因组的发布设定了基因组数据共享的标准,对几乎所有人类基因组学应用都是必不可少的,包括比对、变异检测和解释、功能注释、种群遗传学和表观基因组分析等。当前的人类参考基因组(GRCh38.p13)是由20多个个体的基因组数据组装而成的,其中约70%的序列由单个个体贡献[2-4]。依赖于单个个体基因组序列的基因组组装(不代表任何一个人的序列)会产生参考偏差,对变异发现、基因-疾病关联研究和遗传分析的准确性产生不利影响。在当前GRCh38版本中,有210 Mb的缺失、未知序列(151 Mb)和计算机模拟序列(59 Mb),占主要染色体骨架基因组序列的6.7%。在第一个人类参考基因组草图序列发布20多年后,尽管不断的改进和更新,当前的人类参考基因组仍然存在一些错误、在大多数人类基因组中不存在的罕见结构构型以及因为某些区域具有重复和高度多态性的特性而导致的难以组装的空白间隙,因此人类参考基因组亟待升级[5]。

关键词： 皮肤恶性肿瘤   活检结果   危险分层   前列腺癌   血清前列腺特异性抗原   发病率和死亡率   临床分期  

摘要： 前列腺癌(prostate cancer,PCa)是男性最常见的非皮肤恶性肿瘤。据最新统计,其发病率为男性恶性肿瘤的13.5%,死亡率为6.7%。近年来,中国男性PCa的发病率和死亡率呈明显上升趋势[1-2]。目前,临床常采用血清前列腺特异性抗原(prostate specific antigen,PSA)、活检结果和临床分期,对PCa患者进行危险分层。

关键词： 缺血性脑卒中   生物标志物   多组学   基因组学   转录组学   蛋白组学   代谢组学  

摘要： 生物标志物对缺血性脑卒中的早期诊断及预后评估具有一定的指导意义,已成为当前研究热点。相较于单一类别生物标志物,多组学通过整合基因组学、转录组学、蛋白质组学及代谢组学,可系统反映缺血性脑卒中患者复杂的病理生理过程,在缺血性脑卒中早期诊断方面具备一定的潜力。本文基于缺血性脑卒中相关生物标志物多组学研究现状,对缺血性脑卒中基因组学、转录组学、蛋白质组学、代谢组学相关生物标志物研究进展进行综述,以期为缺血性脑卒中的早期诊断提供参考,并为进一步研究提供更多思路。

关键词： 仔猪病毒性腹泻   宏基因组学   分子特征  

摘要： 旨在了解四川省集约化猪场腹泻仔猪粪便中病毒种群的变化。于2019年从四川省15个猪场采集腹泻仔猪粪便样本共156份,每个猪场挑取3份样本混合成1个pool样,提取其总RNA并进行高通量测序,利用SOAP denovo软件进行序列组装,并对病毒的种类和分子特征进行研究。分析结果显示,腹泻仔猪粪便样本中的病毒种群包括12个科的20种病毒,以冠状病毒科(Coronaviridae)成员为主,与腹泻相关的主要病原有猪流行性腹泻病毒(porcine pidemic diarrhea virus,PEDV)、猪传染性胃肠炎病毒(porcine infectious gastroenteritis virus,TGEV)和猪轮状病毒(porcine rotavirus,PoRV)。获得PEDV N基因的完整基因组和TGEV、猪星状病毒2型(porcine astrovirus,PAstV-2)、posavirus 1和猪细小病毒4型(porcine parvovirus,PPV-4)的部分基因组。系统发育结果显示,PEDV、TGEV、PAstV-2、posavirus 1和PPV-4均与参考毒株有较近的遗传进化关系。研究结果表明,2019年四川地区仔猪腹泻粪便中病毒种类复杂多样,冠状病毒丰度有所上升,为四川省仔猪腹泻的防控提供了一定的数据支撑。

关键词： 阳离子交换膜   苦咸水脱盐   聚醚砜   协同作用  

摘要： 传统均相阳离子交换膜(CEM)基质材料多为侧链型磺化聚合物,该类聚合物制备过程复杂、制备试剂毒性高,凸显此类材料制备CEM的短板。以聚醚砜(PES)为CEM骨架基质材料,以聚合物磺化聚醚砜(SPES)与十二烷基磺酸钠(SDS)为基质功能材料,聚乙烯吡咯烷酮(PVP)为亲水调控剂,制备均相CEM,将制备CEM用于苦咸水脱盐考察实用性。研究结果表明,SDS和SPES稳定存在于制备CEM中,制备CEM表面及断面结构规整、无缺陷,基质材料相容性良好,CEM用于电渗析(ED)苦咸水脱盐,设计初始盐浓度5 000 mg·L^(-1),当脱盐率达90%时,制备的CEM、国内廷润商品CEM、日本Astom CEM的能耗分别为10.1、11.7和9.2 kWh·m^(-3),电流效率分别为92.3%、92.7%和95.5%,SPES和SDS共同作为基质功能材料比SPES或SDS单独作为基质材料更有优势,二者可协同调控优化CEM传质性能。