关键词:
宏基因组二代测序技术
支气管肺泡灌洗液
肺部感染
诊断价值
摘要:
目的应用宏基因组学二代测序(mNGS)技术检测疑似肺部感染患者的病原体,评估mNGS筛查病原体的应用价值,提高临床对于肺部感染患者病原学特征的认识。方法收集2023年2-9月海南省三亚市人民医院收治的45例疑似肺部感染患者的肺泡灌洗液,采用mNGS与常规微生物综合试验(CMT)方法筛选病原体,回顾性分析患者的下呼吸道微生物特征。利用Spearman分析病原体每百万序列数(RPM)与炎症因子的相关性。结果在45例患者中,利用mNGS技术,检出41例阳性,单一感染7例,混合感染34例,包括37例细菌、19例真菌、26例病毒、1例肺炎支原体和1例鹦鹉热衣原体阳性;检出46种病原体,包括26种细菌、8种真菌、10种病毒、2种其他病原体。CMT检出23例阳性,单一感染13例,混合感染10例,包括14例细菌、16例真菌和3例病毒阳性。采用mNGS技术分离出的病原体中,细菌检出率居前5位的分别是铜绿假单胞菌(20.00%)、纹带棒杆菌(17.78%)、鲍曼不动杆菌(15.56%)、肺炎链球菌(13.33%)、肺炎克雷伯菌(11.11%),真菌和病毒检出率最高的分别是白色念珠菌(24.44%)和人类γ疱疹病毒4型(22.22%)。病原体RPM与炎症因子呈一定的相关性。结论mNGS可以初步筛选肺泡灌洗液的病原体,能提高病原体检出率,炎症因子可为评估病原体感染提供参考,但需进一步验证。