关键词:
献血者
病毒宏基因组学
高通量测序
病原体检测
血液安全
摘要:
目的探讨宏基因组学技术在献血人群中病毒鉴定的应用潜力,并评估其在提高血液制品安全性方面的效能。方法采用前瞻性队列研究设计,收集了15名献血者的血液样本。通过QIAamp Viral RNA Mini Kit提取核酸,并使用Phusion~?High-Fidelity PCR Master Mix进行PCR扩增,随后使用NEBNext~?UltraTM DNA Library Prep Kit构建测序文库。样本通过Illumina HiSeq平台进行双端测序,再进行数据质量控制和宏基因组分析。结果在15名献血者样本中,平均总Reads数量为9.86×10^(6)±6.11×105,平均总碱基数为1.55×10^(9)±6.36×10^(7)。质量分数Q20和Q30的平均碱基数分别为1.52×10^(9)±7.04×10^(7)和1.47×10^(9)±5.95×10^(7),平均占比分别为98.81%±0.02%和95.60%±0.06%,GC含量平均占比为65.99%±0.16%。宏基因组分析鉴定出包括Dinovirus,parvovirus,torque teno virus,papillomavirus,Merkel cell polyomavirus,herpesvirus_6A,herpesvirus_6B,human pegivirus,polyomavirus在内的9类病毒。结论宏基因组学技术能够在献血样本中检测到多种病毒,包括传统筛查可能遗漏的类型。该技术可作为提高献血安全性的有效工具,有助于发现和预防病毒传播,但也需要进一步研究以优化数据处理和解释。