关键词:
HIV-1
CRF55_01B
耐药
分子网络
摘要:
目的了解杭州市新报告HIV/AIDS感染者CRF55_01B毒株耐药及分子网络特征。方法收集杭州市2019—2023年新确证且未经抗病毒治疗HIV/AIDS感染病例血样, 通过RT-PCR和巢式PCR扩增HIV-1pol基因并测序。使用MEGA7.0软件构建系统进化树判断亚型, 选取CRF55_01B亚型序列构建分子网络, 提交序列至斯坦福大学耐药数据库, 确定耐药突变位点及毒株对药物的敏感性。结果获得167条CRF55_01B感染者pol基因序列。167例HIV/AIDS感染者总体耐药率9.6%(16/167), 蛋白酶抑制剂(protease inhibitors, PIs)、核苷酸逆转录酶抑制剂(nucleostide reverse transcriptase inhibitors, NRTIs)和非核苷酸逆转录酶抑制剂(non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors, NNRTIs)耐药率分别为1.8%(3/167)、0.6%(1/167)和7.2%(12/167);耐药以低度耐药为主(13例), NNRTIs类耐药位点主要是V179D/E与其他位点协同出现, 另有88.0%(147/167)单独携带V179D/E的感染者表现为潜在耐药。在最适基因距离阈值(0.014)下构建分子网络, 入网率为49.7%(83/167), 鉴别出22个簇。现住址分布网络图显示, 杭州市各地区均有入网病例, 形成1个以萧山区为主和1个均为临平区病例的较大簇。结论杭州市新报告HIV/AIDS感染者CRF55_01B亚型治疗前耐药达到中度流行水平, 毒株传播关系复杂, 存在需重点关注的聚集性传播簇。