关键词:
慢性髓性白血病
红系分化
miRNA-mRNA网络
摘要:
目的:确定慢性髓性白血病(CML)红系分化过程中起关键作用的微小核糖核酸(miRNA)和信使核糖核酸(mRNA),并揭示它们之间的网络调控关系以及其对信号通路的影响。方法:利用GEO数据库筛选出CML红系分化后表达显著改变的miRNA与mRNA,并通过DIANA tools分析平台的TarBase v.8工具与Cytoscape软件构建miRNA-mRNA调控网络,进一步筛选出发挥关键作用的枢纽miRNA。使用DIANA tools分析平台的mirPath v.3工具与Metascape分析平台分别对miRNA与mRNA的进行KEGG信号通路富集分析。最后,通过实时荧光定量PCR的方法验证红系分化对CML细胞枢纽miRNA表达的影响。结果:共筛选出表达显著差异的4281个mRNA与475个miRNA,其中差异最为显著的基因包括ATP2A3、CXCL8、hsa-miR-219a-5p和hsa-miR-154-5p等。miRNA-mRNA网络分析发现,hsa-miR-520c-3p等4个miRNA是表达显著降低miRNA的网络枢纽,而hsa-miR-128-3p等11个miRNA是表达显著升高miRNA的网络枢纽。信号通路富集分析发现差异表达miRNA与mRNA主要富集于PI3K-Akt信号通路等。体外实验结果显示,在氯化血红素处理的K562细胞中,hsa-miR-520c-3p的相对表达量显著减少,而hsa-miR-128-3p的相对表达量则显著增加。结论:通过构建miRNA-mRNA网络全面探讨了CML红系分化过程中miRNA与mRNA之间的调控作用,揭示了发挥关键作用的miRNA与信号通路,为理解CML红系分化的调控机制提供了新视角,并为CML治疗提供了潜在靶标。