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关键词： 长牡蛎   牛磺酸转运蛋白   组织分布   基因家族   表达特征  

摘要： 为查明长牡蛎牛磺酸转运蛋白（Taurine transporter，TauT）基因家族成员组成及其表达特征，采用全基因组筛查策略对长牡蛎牛磺酸转运蛋白基因进行鉴定，并利用qRT-PCR对其组织分布模式和牛磺酸处理下的表达特征进行分析。结果表明：长牡蛎基因组中存在4个CgTauT基因，均包含1个SNF结构域和12个跨膜结构域；4个CgTauT基因在长牡蛎各组织中呈组成性表达，其中CgTauT1在闭壳肌中表达量最高，CgTauT2、CgTauT3和CgTauT4在外套膜中表达量最高，不同组织中CgTauT基因表达量与牛磺酸含量无显著相关性；牛磺酸浸泡处理下4个CgTauT基因在外套膜中呈现不同的时序表达模式，其中CgTauT1的表达量在处理3 h后率先升高，CgTauT3的表达量随处理时间延长呈逐渐升高趋势，CgTauT4的表达量随处理时间延长呈先升高后降低的趋势。研究结果为深入探究CgTauT的生理功能和长牡蛎牛磺酸富集的分子机制奠定了理论基础。

关键词： 蜜蜂残翅病毒   前导蛋白   生物信息学  

摘要： 本研究旨在应用生物信息学方法分析蜜蜂残翅病毒的前导蛋白结构，基于六个不同寄主:西方蜜蜂（Apis mellifera）、安南竹节虫（Medauroidea extradentata）、狄斯瓦螨（Varroa destructor）以及本实验室提取的三种植物叶子花（Bougainvillea spectabilis Willd.) ，紫藤花（Wisteria sinensis.），迎春花（Jasminum nudiflorum Lindl.）的DWV毒株的全基因组序列数据，我们预测并分析了蜜蜂残翅病毒前导蛋白的理化性质、亲疏水性、跨膜区、信号肽、磷酸化和糖基化位点、二级结构和细胞表位。发现所有六种前导蛋白均含有磷酸化位点、糖基化位点和表位，但存在细微差异。这些位点可能影响蛋白活化、细胞取向模式及感染特定细胞的能力，对抗病毒抑制剂设计具有指导意义。研究结果为DWV跨物种传播研究提供了生物信息学基础。

关键词： 豌豆   根腐病   高通量测序   微生物群落   功能预测  

摘要： 根腐病是导致豌豆Pisum sativum大幅减产的主要病害。根际微生物群落结构变化与病原菌丰度升高可能是豌豆根腐病的主要成因；目前尚未见豌豆根腐病植株根际土壤微生物群落组成特征与影响因素的研究。本研究通过高通量测序，比较分析了健康与根腐豌豆植株根际土壤微生物群落组成特征，并探究了土壤理化特性和酶活性对微生物群落的影响。结果表明，健康与根腐豌豆植株根际土壤微生物群落存在明显分化特征。镰孢属Fusarium、亚隔孢壳属Didymella、癣囊腔菌属Plectosphaerella、Setophoma、戴氏菌属Dyella和Granulicella等为根腐豌豆植株根际土壤优势菌群；而毛壳菌属Chaetomium、白腐菌属Albifimbria、白黄笋顶孢霉属Acrostalagmus、芽单胞菌属Gemmatimonas和硝化螺菌属Nitrospira在健康豌豆植株根际土壤中的相对丰度较高。微生物群落功能与表型分类预测表明，根腐豌豆植株根际土壤中潜在植物病原真菌和病原细菌的相对丰度较高，较健康豌豆植株根际分别增加了3.33倍和1.75倍。与健康豌豆植株根际相比，发生根腐病的豌豆植株根际土壤pH、有机质含量、脲酶和蔗糖酶活性降低，而EC值与NH4+-N含量升高（P<0.05），可能有利于病原菌的生长导致根腐病害的发生。本研究为了解豌豆根腐病害成因、促进病害防治提供了科学依据。

关键词： 猪繁殖与呼吸综合征病毒   L1C-like猪繁殖与呼吸综合征病毒   NSP2基因   缺失模式   遗传变异  

摘要： 基因高度突变和重组致使猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）新型毒株不断增加，应对其持续监测。掌握最新流行PRRSV毒株的遗传演变特点，可为我国PRRS的防控提供分子流行病学数据参考。本研究利用RT-PCR方法和测序技术，获取甘肃地区猪群中最新流行的一株PRRSV全基因组序列，通过MEGA、RDP4和Simplot软件对其进行基因序列分析，基于其ORF5基因、NSP2基因和全长基因构建系统发育树并进行基因全长重组分析，对比ORF5和NSP2基因编码氨基酸的变异特点。成功测定PRRSVGSQY12-2023株全基因组序列，长15 032个核苷酸，基于ORF5基因的系统发育分析揭示其属于NADC30-like（L1C-like）毒株的L1C-D分支，其NSP2蛋白出现了新型缺失模式（1+1+111+1+19），重组分析发现该毒株可能由NADC30株和JXA1株分别为潜在主要和潜在次要亲本重组演化而来。本研究首次发现甘肃地区猪群中流行L1C-D-like PRRSV，并报道了其NSP2基因的新型缺失模式，这为PRRSVs的基因多样性和遗传演化研究提供了新的见解。

关键词： 射干麻黄汤   气道高反应   气道炎症   T淋巴细胞   细胞因子  

摘要： 观察射干麻黄汤对气道高反应（AHR）小鼠模型上、下气道T淋巴细胞亚群的影响，分析其“鼻肺同治”控制AHR的生物学基础。采用T细胞β受体基因敲除小鼠提纯γδT细胞；采用卵清蛋白气道致敏的AHR模型小鼠，平均随机分为正常对照组（Ctrl组）、气道高反应模型组（AHR组）、过继免疫γδT细胞组（AIT组）、射干麻黄汤干预组（SGMHT组）、射干麻黄汤+过继免疫组（SMA组），AIT组予以每日γδT细胞尾静脉注射，SGMHT组予以每日射干麻黄汤灌胃，SMA组予以每日γδT细胞尾静脉注射联合射干麻黄汤灌胃，干预7天。观察各组小鼠鼻黏膜和肺组织中T淋巴细胞亚群标记物干扰素-γ（IFN-γ）、白介素-4（IL-4）、视黄酸相关孤儿受体γt（RORγt）、叉头状转录因子P3（FoxP3）及γδT细胞受体（γδTCR）分布情况，外周血Th1、Th2、Th17、Treg、γδT细胞及其细胞因子的表达水平。结果显示，与Ctrl组相比，AHR组鼻黏膜和肺组织中IFN-γ、IL-4、FoxP3、RORγt、γδTCR表达较高，外周血Th2、Th17、γδT细胞比例较高，IFN-γ、IL-2、IL-4、IL-5及IL-17浓度均较高，IL-10、TGF-β则表达较低；与AHR组相比，AIT组、SGMHT组及SMA组鼻黏膜IFN-γ、IL-4、RORγt、γδTCR表达较低，肺组织IL-4、γδTCR较低，外周血Th1比例较高，Th17、γδT较低，SGMHT组和SMA组IFN-γ、IL-2、IL-4、IL-5及IL-17浓度较低，IL-10、TGF-β较高。实验明确了射干麻黄汤“鼻肺同治”改善AHR模型小鼠的作用，其机制与全面调控T淋巴细胞亚群有关。研究为揭示射干麻黄汤治疗AHR作用机制、促进临床应用奠定基础。

关键词： 甲型流感病毒   神经氨酸酶   抗原表位   抗体   抗体配位相似性  

摘要： 目的 基于甲型流感病毒神经氨酸酶（neuraminidase，NA）蛋白抗原抗体复合物结构数据，探究抗原蛋白表位与抗体的空间结构识别关系。方法 完整收集SAbDab数据库中NA蛋白抗原抗体复合物结构数据，对蛋白质结构进行处理分析，获取抗原表位和相应抗体配位氨基酸序列和空间分布信息，统计分析结合抗体序列、基因使用频率、氨基酸使用偏好性和CDR区氨基酸长度；分析抗体结合的热点区域，进一步对抗体配位空间结构相似性进行计算和层次聚类，深入探究抗原表位与抗体的空间识别关系，通过BLI实验验证靶向不同抗原表位的抗体的识别特异性。结果 SAbDab数据库中甲型流感病毒NA蛋白的抗原抗体复合物结构数据以H3N2、H7N9、H1N1亚型为主，抗原表位的热点位置主要集中在催化活性位点区域，抗体物种来源以人源和鼠源为主，鼠源抗体VJ基因组合使用频率最高的是IGHV1-12*01/IGHJ2*01，人源抗体VJ基因组合使用频率最高的是IGHV1-69*01/IGHJ6*01。结合在催化活性位点区域内与结合在催化活性位点区域以外其他区域的抗体，在重链CDR区氨基酸长度与氨基酸使用偏好性方面存在显著差异。抗原表位与抗体配位具有特定的识别关系，部分相似的抗体配位结构特异性地识别相同的表位，可在结构上观察到结合区域的重叠，BLI实验也验证了这类抗体对表位的竞争结合。结论 NA蛋白抗原表位位点分布以催化活性位点及周围环状区域为主，空间构象互补与静电相互作用在抗体与抗原的催化活性区域识别和结合过程中发挥重要作用。抗原与抗体存在不依赖于抗体惟一序列的空间识别关系，不同序列的抗体也可能形成识别同一抗原表位的局部空间结构。

关键词： 蛋白质标记   口蹄疫病毒   VP1蛋白   点击化学   非天然氨基酸  

摘要： 将荧光标记分子引入细胞内表达的口蹄疫病毒（FMDV）结构蛋白VP1的特异性氨基酸位点，从而实现在活细胞内对蛋白质的动态可视化标记。先对VP1蛋白中非天然氨基酸（UAA）插入位点进行筛选，并利用遗传密码子扩展技术将UAA定点插入到VP1蛋白，并通过生物正交点击化学反应引入荧光分子，观察细胞内的荧光标记蛋白；进一步通过间接免疫荧光试验验证荧光标记的蛋白。结果显示，成功筛选出VP1蛋白中UAA插入效率较高的氨基酸突变位点，并可以通过UAA控制VP1蛋白的表达。证实荧光分子染料DIBO-Alexa Fluor-488与VP1蛋白上的UAA发生点击化学反应可以进行活细胞染色，同时进行间接免疫荧光染色，可以观察到两种染色结果存在共定位趋势。本研究采用新方法实现了活细胞内FMDV VP1蛋白特异位点的荧光标记，为VP1蛋白功能研究和在细胞内示踪FMDV的感染及复制过程奠定了基础。

关键词： Clinical Immunology  

ISBN: (数字)9781683674023 ISBN: (纸本)9781683673996

摘要： THE authoritative guide for clinical laboratory immunology For nearly 50 years, the Manual of Molecular and Clinical Laboratory Immunology has been the premier resource for laboratories, students, and professionals involved in the clinical and technical details of diagnostic immunology testing. The 9th Edition continues its tradition of providing