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摘要： Through a reconstruction of Gilbert Simondon's work using perspectives from contemporary philosophy of science, I pursue an ontogenetic study of machine learning -an investigation into the process by which machine learning models become what they are and do what they do -with the aim of understanding and addressing their role in knowledge production. This investigation unfolds as two parts: Genesis and Genealogy. By studying the genesis of the ML-model, I seek to identify the role (or lack thereof) of human cognition in the formation of the ML-model and illustrate its significance for our knowledge about the world. By studying the genealogy of the ML-model, I aim to address how different scientific communities and their respective knowledge practices are affected by their interaction with and integration of machine learning models.

摘要： 胚胎植入前遗传学检测(PGT)是一种在卵胞浆内单精子注射(ICSI)过程中选择正常胚胎进行移植的技术, 适用于基因缺陷、染色体异常、高龄女性、复发性流产、反复种植失败和严重畸形精子症。自首例PGT成功至今已有30余年, PGT技术在临床应用上有了长足的发展, 为患有遗传疾病及不孕不育患者带来了生育健康后代的希望。本研究旨在探讨单枚冻融囊胚移植周期, 以确定与IVF/ICSI相比, PGT是否与更高的不良围产期结局风险有关。

关键词： 45,X/46,XY   性腺发育异常   嵌合体   染色体核型  

摘要： 目的:分析混合型性腺发育不良患儿临床特点、性腺特征及分子遗传学特点,讨论该类型患儿临床表型特征及其分子遗传学特点间的关系,以提高对该病的认识和诊疗能力。方法:采用回顾性分析的方法,对2010年1月到2023年1月间在成都市妇女儿童中心医院就诊的12例混合型性腺发育不良患儿(染色体核型为45,X/46,XY嵌合体型或其变异型患儿)的临床表现、性激素水平、影像学检查、性腺表型及性腺病理特征与患儿分子生物学特点的相关性进行总结分析。结果:(1)共有12例混合型性腺发育不良患者纳入研究,其中10例患者依靠G显带方法确诊,2例经由进一步完善FISH检测确诊,12例患者中2例完善SRY基因阳性。(2)12例患者中10例社会性别为女性,2例社会性别为男性。纳入研究的患者外生殖器表型广泛,从完全男性表型、性别模糊、完全女性表型均有分布,根据外生殖器男性化评分及Prader分型12例患者进一步分为女性表型(8例),外生殖器性别模糊(2例),男性表型(2例)。其中社会性别女性患儿EMS评分得分为0～4分间,Prader分型在0型到3型间,社会性别男性患儿EMS评分得分为11～12分间,Prader分型为5型到6型间。(3)通过查体及影像学检查,性别模糊的2位患者均未见卵巢及睾丸;男性表型的2位患者性腺为睾丸(2/2);女性表型的8位患者1例可见双侧卵巢样性腺(1/8)、1例可见睾丸样性腺(1/8)、6例未见确切性腺组织(6/8);在进一步行腹腔探查术的7位患者中,2例外生殖器性别模糊患者病理均为单侧条索对侧睾丸(2/2),5例女性表型患者中3例病理提示双侧条索样性腺(3/5)、1例提示一侧缺失对侧卵巢(1/5)、1例术中见双侧性腺缺失(1/5);7例手术患者中2例患者术后病理发现性腺母细胞瘤(28.57%)。(4)研究中混合型性腺发育不良患者就诊年龄分布在0.84岁～16岁间,初诊原因主要为性发育异常及/或身材矮小(性发育异常就诊患者5例,身材矮小就诊患者6例,两者同时存在就诊1例)。(5)研究中所有患者均存在不同程度的身材矮小,女性表型患者身高标准差平均值为-2.22SD,男性表型患者身高标准差平均值为-1.89SD;半数患者存在多种类Turner综合征体征。所有患者均存在高促性腺激素性性腺功能减退。结论:混合型性腺发育不良患者虽外生殖器及性腺表现差异较大,但大部分患者存在身材矮小,部分患者存在类Turner综合征体征。EMS评分作为较系统的外生殖器评分方法其评分高低在一定程度上可提示性腺的分化程度。混合型性腺发育不良患者临床表型与外周血染色体嵌合比例无明显相关性。混合型性腺发育不良患者性腺母细胞瘤风险高,女性表型患者发病率较男性表型患者更高。建议所有混合型性腺发育不良患者均早期行腹部探查术并行性腺组织活检评估性腺发育情况并除外肿瘤风险。

关键词： 失眠   人格特征   分子遗传学   BDNF基因   DRD4基因   5-HTTLPR基因  

摘要： 目的:(1)比较慢性失眠障碍患者和健康对照的人格特征,以了解患者的人格特征,为失眠制定预防策略提供依据;(2)采取候选基因策略,比较慢性失眠障碍患者与健康对照基因多态性之间的差异,以寻找慢性失眠障碍可能的风险基因;(3)寻找慢性失眠障碍患者的人格特征与脑源性神经营养因子(BDNF)基因、多巴胺D4受体(DRD4)基因、五羟色胺转运体(5-HTTLPR)基因之间的关系,以探讨可以作为慢性失眠障碍遗传内表型的人格特征。方法:本研究为病例对照研究,选取2021年11月-2022年09月就诊于绵阳市第三人民医院慢性失眠障碍患者74名,面向社区招募并匹配健康对照者74名。采用卡特尔十六人格因素量表(16PF)、三维人格问卷(TPQ)进行人格特征的评定;基于既往研究结果及NCBI数据库(https://***/)选择BDNF基因(rs6265)、DRD4基因(rs1800955)、5-HTTLPR基因(rs2020936)共3个单核苷酸多态性(SNP)位点,采用PCR技术和SNa Pshot技术对以上SNP位点进行基因分型检测。运用SPSS25.0统计软件进行数据分析。结果:(1)16PF结果显示慢性失眠组与健康对照组相比,稳定性C(P<0.05)、幻想性M(P<0.01)得分较低,敏感性I(P<0.05)、忧虑性O(P<0.01)、紧张性Q4(P<0.01)得分较高;(2)TPQ结果显示慢性失眠组在伤害回避(HA)维度得分较健康对照组高(P<0.01),其中的悲观—乐观主义因子(HA1)及易疲劳因子(HA4)得分均高于健康对照组(P<0.01),其余因子无显著性差异;慢性失眠组奖赏依赖(RD)维度得分及依恋因子(RD3)较健康对照组高(P<0.05);(3)慢性失眠组与健康对照组在BDNF基因(rs6265)的基因型及等位基因频率分布上存在显著性差异(P<0.05),慢性失眠组的AA基因型及A等位基因频率高于健康对照组;携带A等位基因的慢性失眠患者相较于未携带A等位基因的慢性失眠患者在16PF中的实验性Q1得分更高(P<0.01)。DRD4基因(rs1800955)、5-HTTLPR基因(rs2020936)基因型频率及等位基因频率两组分布上未发现显著差异。结论:(1)16PF评估结果显示慢性失眠患者具有低稳定性、幻想性,高敏感性、忧虑性、紧张性的特点;(2)TPQ评估结果显示慢性失眠患者在躲避伤害性得分更高,提示患者面对负性刺激时倾向于回避;两个因子分则提示慢性失眠患者倾向于预期焦虑、悲观主义、易疲劳。另外在奖赏依赖性上慢性失眠患者的得分也更高,依恋因子分高提示人群依恋,对社会信息和他人求助敏感,力图帮助和取悦他人;(3)BDNF基因(rs6265)的多态性可能与慢性失眠障碍有关,携带有A等位基因可能为慢性失眠障碍的风险因素;(4)慢性失眠障碍患者中16PF中的实验性(Q1)可能与BDNF基因(rs6265)相关。

关键词： 胚胎植入前遗传学检测   地中海贫血   单基因病   单核苷酸多态性   抗缪勒管激素   窦卵泡数目   获卵数   胚胎植入前遗传学检测   地中海贫血   单核苷酸多态性  

摘要： 第一部分胚胎样本中不同地贫基因型捕获深度比值参考范围的探讨研究目的探讨活检胚胎样本中不同地贫基因型捕获深度比值的参考范围,寻找参考胚。研究方法纳入自2019年8月至2021年11月因夫妻双方地贫携带就诊于广州医科大学附属第三医院（以下简称广医三院）生殖中心行PGT的家系。依据该家系活检胚胎的地贫基因型将其分为3个组:(αα/--)组、无突变组、(--/--)组。选取胚胎植入前单基因遗传病检测panel中16号染色体SNP数据,计算目标区域（致病基因区域）与非目标区域的平均测序深度比值为捕获深度比值,比对各组胚胎地贫基因型与捕获深度比值之间的关系,建立胚胎样本中不同地贫基因型的捕获深度比值参考范围。数据应用统计学软件SPSS25.0分析,利用Kolmogorov-Smirnov对数据进行正态性检验,符合正态分布,可用均数和标准差衡量,不符合正态分布,则需用中位数及四分位数来衡量或将数据进行变量转换,若变换后的数据符合正态分布,也可用均数和标准差衡量。研究结果1.在(αα/--)组捕获深度比值的统计分析中,其显著水平Sig<0.05,数据不符合正态分布,其偏度值（1.414）为标准差（0.2452）的3倍以上,呈中度的正偏态分布,对数据取对数（ln）转换,转换后的数据显著水平Sig>0.05,符合正态分布,可用均数（-0.9280）和标准差（0.5379）衡量。估计(αα/--)组捕获深度比值对数转换后95%参考范围为（-1.9823,0.1262）,则估计原数据95%参考范围为（0.1378,1.1345）。2.在无突变组捕获深度比值的统计分析中,其Sig>0.05,符合正态分布,可用均数（0.7213）和标准差（0.2468）衡量。估计无突变组捕获深度比值95%参考范围为（0.2376,1.2049）。3.(--/--)组捕获深度比值均小于0.01。研究结论1.(αα/--)组和无突变组的捕获深度比值95%参考范围间重叠区域大,捕获深度比值无法预测基因型为(αα/--)或无突变的胚胎作为参考胚用于构建夫妻双方单倍型,用于胚胎致病性的检测。2.(--/--)组与(αα/--)组和无突变组的捕获深度比值间无重叠,捕获深度比值可以预测基因型为(--/--)的胚胎作为参考胚用于构建夫妻双方单倍型,用于胚胎致病性的检测。第二部分影响获得参考胚的临床因素研究研究目的探讨参考胚与受试者活检胚胎数之间的关系及影响受试者术中获卵数的相关因素。研究方法纳入自2019年8月至2023年2月因夫妻双方地贫携带就诊于广医三院生殖中心行PGT的家系。按照受试者可供活检胚胎中是否含参考胚(--/--)将家系分为2组:含参考胚组、不含参考胚组,探讨参考胚与受试者活检胚胎数之间的关系。数据应用统计学软件SPSS25.0进行统计分析,使用简单线性回归模型分析活检胚胎数与不含参考胚家系数间的相关性,P<0.05认为差异有统计学意义。依据术中获卵数的第25百分位数和第75百分位数将周期获卵数分成三组:≤8组,9～20组,≥21组。利用Kolmogorov-Smirnov对数据进行正态性检验,符合正态分布用均数±标准差表示,组间比较采用单因素方差分析,不符合正态分布用中位数（第25百分位数,第75百分位数）表示,组间比较采用非参数Kruskal-wallis H检验。计数资料采用频数、百分率或构成比（%）进行描述。使用多元logistic回归分析影响术中获卵数的因素,包括年龄、AMH、AFC、BMI及FSH,并评估影响因素的比值比（OR）和95%置信区间。采用ROC曲线参考胚的临床影响因素进行数据管理与分析。同时,对不同促排卵方案下的获卵情况进行方差分析,计量资料以均数±标准差表示。统计学处理采用SPSS25.0软件,P<0.05认为差异有统计学意义。研究结果1.活检胚胎数与不含参考胚家系数间呈显著负相关且具有统计学意义（r=-0.810,P<0.001）。当可供活检胚胎数≥4时,有83.1%的几率可以找到参考胚,获得参考胚的几率随可供活检胚胎数的增加而增加。2.获卵数与活检胚胎数间呈显著正相关且具有统计学意义（r=0.233,P<0.001）。3.三组患者在年龄、BMI及FSH差异均无统计学意义（P均>0.05）,在AMH、AFC间差异均有统计学意义（P均<0.05）。4.在获卵数≤8组与≥21组的比较中,AMH、AFC是显著影响因素（P均<0.05）;在获卵数9～20组与≥21组的比较中,AMH是显著影响因素（P<0.05）;在获卵数9-20组与≤8组的比较中,AFC是显著影响因素（P<0.05）。***是影响获卵数的独立因素（P≤8/≥21=0.001,P9-20/≥21=0.02）,AFC也是影响获卵数的独立因素（P≤8/≥21=0.001,P≤8/9-2

关键词： 医学文本   译后编辑   信息等价性  

摘要： 本实践报告以《精神类处方药物:从药物相互作用到遗传学》(Prescribing Psychotropics:From Drug Interactions to Genetics)第2-6章为翻译实践内容。主要介绍精神类处方药物的药代动力学,为精神科医生临床用药提供指导作用。本报告着重分析在爱特曼云翻译+Yi-CAT平台的辅助下,医学文本再现原文信息的译后编辑,以及在译后编辑中遇到的困难及解决办法。本翻译实践报告的原文是医学类文本,属于信息型文本,特点是信息量大,信息密度高。为提高医学翻译的效率,笔者选用了机器翻译+译后编辑的翻译模式,总结机器翻译的错误及译后编辑策略。本文结合冯志杰阐述的“信息等价性”的理念和医学文本的特点,对译后编辑过程中如何再现“信息量”和“信息重心”进行讨论。“信息量”的再现旨在解决译后编辑过程中对于原文信息完整性的再现,体现在专业术语、缩略语和指称词的再现上;“信息重心”的再现旨在解决译后编辑过程中,医学文本信息密度高、信息重心不突出带来的翻译困难,体现在被动语态、复合句和逻辑问题的再现上。通过翻译实践发现,医学文本汉译可以采用爱特曼云翻译+Yi-CAT平台的MTPE模式,该模式能够大大减少译者工作量并提高医学文本汉译的翻译质量和效率。笔者希望通过本次翻译实践,提高自身译后编辑的能力,积累医学相关领域知识,也希望能为医学文本的译后编辑提供参考。

关键词： 高苯丙氨酸血症   苯丙氨酸羟化酶   6-丙酮酰四氢蝶呤合成酶   基因突变   江西省  

摘要： 目的:高苯丙氨酸血症(hyperphenylalaninemia,HPA)是一种由苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)或四氢生物蝶呤(tetrahydrobiopterin,BH4)缺乏引起氨基酸遗传代谢病。PAH和BH4在苯丙氨酸(phenylalanine,Phe)转化为酪氨酸的过程中起关键作用,调控机体代谢Phe的速度。过量的Phe在体内蓄积会造成发育迟缓、智力低下、癫痫等一系列不可逆神经系统症状。HPA也是一种可预防、可治疗的疾病,其中新生儿筛查是预防HPA的有效方法。不同国家、不同地区HPA的发病率及相关基因的热点突变差异较大,完善各地区PAH基因及PTS基因的突变谱对于提高人口素质具有重要意义。本研究通过对江西地区2008-2022年筛查诊断的HPA患者进行HPA相关基因变异分析,从而构建江西地区HPA相关基因的突变谱,为HPA的遗传咨询、产前诊断、基因治疗提供重要参考。方法:1、江西省妇幼保健院新生儿疾病筛查中心共诊断191例苯丙氨酸羟化酶缺乏症(PAHD)患者,对其中130例PAHD患者的PAH基因进行Sanger测序及MLPA分析,明确患者PAH基因突变位点,并对其父母的相应突变位点进行验证,利用等位基因表型值(APV)/基因型表型值(GPV)模型预测表型,将实际表型与预测表性进行对比。2、江西省妇幼保健院新生儿疾病筛查中心共诊断74例四氢生物蝶呤缺乏症(BH4D)患者,对其中53例6-丙酮酰四氢蝶呤合成酶缺乏症(PTPSD)患者进行Sanger测序明确患者PTS基因突变位点,并对其父母的相应突变位点进行验证。结果:1、PAHD的发病率为1:30579,在130例PAHD患者中,共检测出241个突变位点及8个大片段缺失,包含82种突变类型,其中R243Q突变频率最高(33/240,13.25%)、R241C次之(15/240,6.02%)。2、共纳入93例PAHD患者进行APV/GPV基因型-表型预测,其预测表型-实际表型一致性达到76.34%(71/93),其中经典型PKU71.43%(40/56)、轻度PKU70.59%(12/17),轻度HPA95%(19/20)。3、在130例PAHD患者中发现了IVS6+2T>A、D145H两个新基因突变。4、江西地区BH4D的发病率为1:78919,在53例PTPSD患者中,共检出106个突变位点,包含15种突变类型,其中P87S突变频率最高(47.17%)、IVS1-291A>G次之(19.81%)。结论:本研究构建了江西地区PAH基因和PTS基因突变谱,明确了PAH基因及PTS基因的突变热点,丰富了基因数据库,为江西地区HPA患者的诊断及治疗奠定了基础,并为基因型-表型预测模型提供了数据。

关键词： 遗传学综合实验   数量性状   细胞质遗传   PCR   ITS   rbcL  

摘要： 文章对“学生采集云南农业大学野生扁穗雀麦居群数量性状数据并分析，分别利用核DNA及叶绿体DNA通用引物ITS及rbcL扩增所采集个体总DNA，电泳检测”作为遗传学综合实验教学案例的实施过程、效果及可行性进行了验证和探讨。实验以昆明常见野生扁穗雀麦作为实验材料，一个实验班的学生每人采集一株植株的株高、分蘖、有效穗数、平均穗长、平均小穗数5个数量性状，全班数据共享，进行方差分析；每个同学分别提取所采植株总DNA，一半学生利用引物rbcL、另一半学生利用引物ITS进行PCR扩增，电泳检测扩增产物。结果显示，ITS扩增片段约750bp,rbcL扩增片段约500bp。此综合性实验是充分利用地方资源，并将科研成果应用于本科实验教学的一个有益探索。

关键词： 耧斗菜复合体   物种形成   谱系分化   适应性进化   群体遗传学  

摘要： 物种如何分化成不同的谱系是进化生物学的核心问题。尽管越来越多的证据表明谱系分化不需要地理隔离,但其与表型差异之间的相关性并不清晰,且谱系间的基因流在分化过程中的作用有待探究。本研究使用广泛分布的耧斗菜复合体(Aquilegia viridiflora complex)(包括耧斗菜*** Pall.、龙江耧斗菜*** ***,Schaulo et Schmakov以及河北耧斗菜*** Erst)作为研究对象,探究了物种形成早期表型分化的遗传基础。结合表型测量、转录组测序和基因组重测序等方法,对耧斗菜复合体的表型分化、基因表达模式、群体遗传结构、群体动态历史和选择适应性等方面进行分析;组装了耧斗菜复合体高质量染色体水平的基因组,进而揭示其物种形成过程和适应性进化机制,并对该物种谱系分化的驱动力进行推断。主要研究结果和结论如下:(1)耧斗菜复合体的表型和基因表达模式分化表型测量及统计分析结果显示龙江耧斗菜和耧斗菜之间无明显表型差异,而河北耧斗菜与二者间存在明显的表型差异。与耧斗菜和龙江耧斗菜相比,河北耧斗菜具有更小更多的花,这可能与不同的环境和传粉者组成的适应相关。此外,基因的差异表达分析结果表明,下调的差异表达基因可能参与了花部特征分化的调控。同时,在与表型具有相关性的基因模块中鉴定出MADS、MYB和NAC等重要的转录因子,这些转录因子可能通过调控基因表达,影响与传粉者组成差异适应相关的花部特征。(2)隔离和自然选择驱动耧斗菜复合体的谱系分化和表型分化基于表型数据和基因组重测序数据的结果,本研究发现耧斗菜复合体谱系分化和表型分化存在不一致性,这可能与谱系之间连续的基因流有关。群体动态历史分析显示,中更新世发生的重大气候转变可能是耧斗菜复合体分化为四个谱系的原因之一。虽然地理隔离和自然选择也导致了耧斗菜复合体的谱系分化,但是具有相似生境的异域谱系在面对相似的选择压力时并没有出现表型分化,说明异域类群既可以在不同的选择压力下发生适应性生态分化,也可以在相似的选择压力下发生谱系分化。(3)高质量基因组的组装与注释揭示耧斗菜复合体广泛分布的遗传基础本研究利用二代测序技术和三代测序技术相结合的方法组装并注释了耧斗菜染色体水平的基因组,其Contig N50的长度为18.25 Mb,大小为315.32 Mb,包括116 Mb(36.64%)的重复序列,33,956个蛋白质编码基因和45,224个转录本。其中,93.22%的转录本得到了功能注释。比较基因组分析结果显示,耧斗菜与耧斗菜属其他植物的分化时间约为8.56 Mya,并且耧斗菜属物种经历了相同的全基因组复制事件。在耧斗菜基因组中,188个基因家族经历了扩张,392个基因家族经历了收缩,扩张的基因家族与糖基化相关,收缩的基因家族与次级代谢产物的合成相关,这些基因家族的进化可能是耧斗菜复合体能够广泛分布的遗传基础之一。综上所述,本研究提供了中更新世物种形成的例子,并表明与耧斗菜复合体的适应性谱系分化可能是由中更新世气候转变驱动的,这将进一步促进耧斗菜复合体和东亚其他物种的分类与进化的研究。此外,耧斗菜高质量基因组的组装为深入挖掘驱动耧斗菜复合体谱系分化的基因功能研究提供了基础,而且在进化生物学、发育生物学和次生代谢产物的合成途径等领域的研究中将发挥重要的作用。