关键词:
PKD1基因
多囊肾
单体型构建
植入前遗传学检测
摘要:
目的探讨通过长读长测序技术构建SNP单体型,为成人常显多囊肾基因(PKD1)致病变异且家系不全患者行胚胎植入前遗传学检测策略提供参考。方法选取2022年1月至2022年9月于柳州市妇幼保健院生殖健康助孕中心就诊的两名患者,分别患有PKD1 c.5976_5978del杂合变异复合PKD1 c.11333C>A杂合变异和PKD1 c.11969 T>G杂合变异导致的常染色体显性遗传多囊肾且家系不全,采集患者夫妻双方外周血提取高质量DNA,通过长读长测序技术构建SNP单体型。活检胚胎滋养外胚层细胞进行全基因组扩增,再利用ASA芯片检测胚胎SNP位点信息,结合长读长测序构建的男女方SNP位点建立连锁分析,分析胚胎变异位点携带情况;同时以Sanger测序检出的受累胚胎作为先证者,利用Karyomapping芯片检测分析胚胎SNP位点单体型;比较两种连锁分析结果的一致性。结果病例1检测5个胚胎,病例2送检4个胚胎。病例1的1号,3号和4号胚胎携带男方PKD1c.5976_5978del致病变异,病例2的1号及4号胚胎均携带有男方PKD1 c.11969T>G致病变异;经Sanger测序均选择1号胚胎作为参照,利用Karyomapping芯片进行连锁分析,病例1的1号,3号和4号,病例2的1号及4号胚胎均携带男方的致病变异,结果与长读长测序家系连锁分析一致。结论对于家系不全PKD1患者,可通过长度长测序进行男女双方的致病位点确定及SNP单体型构建,通过SNP单体型建立连锁分析,从而准确有效的进行胚胎植入前遗传学检测。